肝小静脉闭塞症多以对症支持治疗为主。首先，要避免接触砷、汞等有害物质，同时避免食用含吡咯类生物碱的茶叶以及草本植物，如土三七等。
其次，可以使用抗凝药物以及去聚类药物，如华法林等，或者考虑短期应用糖皮质激素治疗。对可能发生的并发症做及时处理，必要时还要输白蛋白以及血浆。如果发生门脉高压症，可以选择门腔分流术。
最后，肝小静脉闭塞症患者要吃清淡、易消化食物，保证蛋白质的摄入，多吃新鲜的蔬菜、水果，增加维生素的摄入。