泡性结膜炎既不是细菌感染，也不是病毒感染，属于结膜的一种变应性的反应，其中可能对某种细菌有过敏反应，与外源性的感染是没有任何的关系，属于内源性的反应，所以临床是不需要去区分泡性结膜炎是细菌还是病毒。
因为在治疗上是选用激素类的眼药，尽管它的症状与细菌性结膜炎和病毒性结膜炎有相似的地方，都可以出现异物感、眼红、畏光、流泪等不适症状。
但眼科的检查情况是不一样的，在临床上一定要鉴别开，可以指导性的用药治疗。