睡觉被肛门里疼醒，可能是以下原因引起：
1.肛周脓肿。这是一种急性化脓性疾病，是由于细菌感染引发，特别是在晚上睡觉的时候周围比较安静感觉疼痛比较明显。如果脓腔里面压力增高，有可能会发生破溃。
2.炎症。包括肛门炎、肛管炎，由于炎症介质刺激肛周的神经，也可导致肛门里面发生疼痛，导致睡觉的时候被疼醒。
3.痔疮。比较严重的痔疮会脱出肛门导致充血、水肿，特别是形成嵌顿痔，由于局部缺血血液回流不畅形成血栓，导致肛门里面疼痛剧烈。晚上睡觉的时候交感神经兴奋，感觉疼痛明显被痛醒。