继发性肝癌和原发性肝癌的区别在于引起两种肝癌发生的病因、病情发生发展以及相关检查的不同。
引起原发性肝癌发生的具体原因尚不明确，目前考虑有可能与肝硬化、病毒性肝炎以及某些有毒有害的化学物质有关；而继发性肝癌通常是由于身体其他部位的恶性肿瘤细胞转移至肝脏后，在肝脏内形成恶性肿瘤，其原发灶有可能位于胃、胰腺、结肠、子宫等部位。
继发性肝癌的病情进展较原发性肝癌慢，肿瘤标志物、甲胎蛋白检测多为阴性，并且继发性肝癌的患者大多数并没有肝脏疾病史。