早上醒来腰疼可能与局部的腰肌劳损有关，比如在夜间睡眠时姿势不对或床垫太软等因素，影响诱发腰部肌肉出现劳损，进而导致在早晨起来后腰疼。
如果患者腰椎不好，如果夜间身体着凉，可能会导致气滞血瘀，进而引起腰椎症状加重，也可能会造成早晨起来腰疼现象发生。对此患者需要做好夜间的保暖，并尽量地选择硬床板睡觉。如果腰椎不好，可以进行系统的治疗。
如果患者身体缺钙导致骨骼出现骨质疏松症状，由于夜间身体的血液循环降低，进而也可能会导致晨起时出现腰部疼痛的症状表现。