造成同型半胱氨酸升高的原因，首先就是性别因素，雌激素可能具有调节同型半胱氨酸作用，女性比男性普遍要低一些。
其次就是进食了高蛋白的饮食，因高蛋白食物分解代谢可以产生同型半胱氨酸。还有就是肾功能异常，会引起同型半胱氨酸的代谢异常造成，同型半胱氨水平升高还可能是缺乏维他命如叶酸、吡哆醇（B6）或钴胺素（B12）等。药物如卡马西平、异烟肼，恶性肿瘤、银屑病、甲状腺功能低下，咖啡、酒精、吸烟等，也可导致半胱氨酸的增高。