导致宝宝手背长水疱的原因不同，处理措施也不一样。
如果是病毒感染所引起的水疱，大多见于手足口病。如果是轻度的手足口病，大多具有自限性，主要是做好日常的护理，保持局部皮肤的清洁和干燥，避免继发细菌感染，并且经常测量宝宝的体温。
如果是重度的手足口病，要及时就医进行检查和治疗，主要是进行抗病毒以及退热等对症治疗。在治疗过程当中，也要注意宝宝体内水分和电解质的补充，避免出现脱水以及电解质紊乱。
如果是过敏性因素所导致的宝宝手背上长水疱，应当远离过敏原，并且使用外敷和口服的抗过敏药物进行治疗。