阵发性房颤当然会引起心脏血栓。无论是阵法性房颤还是持续性房颤或者永久性房颤，都可以形成心脏内的血栓。主要是心房内形成血栓，以左右心耳部分比较常见。
原因是因为在发生房颤的时候，心房内血流淤滞，而血液中的一些脂质成分会附着在心房的内壁导致血栓的形成。与血栓形成的因素与高脂血症直接相关，所以需要积极的来控制血脂。
首先从清淡饮食开始，避免食用高胆固醇的食物，适当的增加运动锻炼。同时针对房颤的患者，要根据血栓风险的评分标准来明确何时开始进行长期的抗凝治疗。抗凝药物可以选择华法林、利伐沙班或者达比加群酯。选用华法林时应该常规的监测国际标准化比值。
房颤的最重要的一个危险因素就是血栓栓塞性疾病，就是因为心房内形成血栓，血栓脱落以后随着血流会堵塞到相应的器官而引起器官栓塞的表现，最常见的是脑栓塞、肺栓塞、肠系膜上动脉栓塞等。