滴虫病用抗滴虫的药物效果比较好，在临床上常用的有甲硝唑和奥硝唑。
如果是滴虫性阴道炎，在阴道用药时一定要夫妻两个人同时用药。因为这个病传染性非常强，只要在发病一个月内有性生活就会传染给男性，从而导致男性成为带虫者。当女性治愈了以后，又会通过性交传染给女性，导致女性经久不愈。
滴虫性阴道炎很容易在女性阴道防御功能下降的时候复发，尤其是月经干净以后。为了防止复发，最好每次月经干净后用药物治疗一周，这样用三次。