小儿脑电图异常要根据检查结果，以及临床的症状再辅助其他的检查，进一步确诊病因再给予相应治疗。
引起脑电图异常，有可能是癫痫导致的，确诊后要给予长时间地服用抗癫痫的药物治疗，临床比较常用的药物有卡马西平、苯妥英钠等，服用的剂量要根据小儿的体重以及病情的轻重来决定。
如果是脑膜炎等感染引起的脑电图异常，需要尽快住院输液治疗，积极地给予抗感染的药物，例如阿莫西林克拉维酸钾、头孢克肟颗粒等控制炎症，炎症得到消退后脑电图会逐渐恢复正常的状态。