肾的先天性畸形是在胚胎时期形成的，所以患者出生之后，对于肾脏的畸形没有办法进行纠正，只能对肾脏畸形所带来的症状，进行一系列的对症治疗。
对于没有症状的先天性肾脏畸形，可以不用采用任何治疗方法，平时勤检查即可。有些先天性肾脏畸形，可以反复的出现泌尿系的感染，反复泌尿系感染的患者要给予抗炎的治疗。
在泌尿系感染的同时患者可能会形成肾结石，甚至诱发尿道梗阻。此种情况可能需要给予手术治疗，纠正患者可能存在的尿道狭窄，以免反复出现泌尿系结石和感染。