导致精子形态异常的病因不同，用药也不一样。如果精子形态异常为生殖系统感染疾病所引起，比如睾丸炎、附睾炎等，在确诊以后主要是进行抗感染治疗，可通过使用头孢菌素类或喹诺酮类的药物进行治疗，比如头孢地尼、左氧氟沙星等，将感染因素消除后，精子的形态就会逐渐恢复正常。
如果精子形态异常为其他因素所引起，比如经常接触化学物质、长期接触辐射、吸烟、喝酒，可通过服用生精的药物进行调理，比如五子衍宗丸、生精片等。
并且也要消除以上因素，避免接触化学物质以及辐射，戒烟、戒酒，多注意休息。