功能性胃肠病不是慢性胃炎。无论是从病因、症状、治疗方法等都存在差异性，这是两种不同类型的疾病。
对于功能性的胃肠病主要是由于生理、精神、心理因素、环境因素等原因所导致的消化系统疾病，但是在进行相关检查时无器质性病变存在。慢性胃炎多是由于幽门螺杆菌感染、长期喝酒、长期吃过热的食物、长期吸烟、长期服用对胃肠道有损伤的药物等，多种原因所引起的胃黏膜慢性炎症。
对于功能性胃肠病的患者，需要消除患者的顾虑，改善症状。对于慢性胃炎，在治疗时需要针对病因进行治疗。