做纤维鼻咽镜检查一般没有太明显的痛苦，但是也和医师的操作熟练程度以及病人的配合程度有关系。
如果检查医生资历比较老，经常做纤维鼻咽镜检查，手法比较成熟，病人配合比较好，没有明显的抗拒心理，患者鼻腔通畅、鼻腔条件好、没有明显的肿物狭窄以及息肉生长、鼻咽镜进展比较顺利，这种情况下就不会容易造成鼻出血、鼻腔疼痛等一些比较痛苦的体验。
如果病人检查不配合或者是检查医师手法比较粗糙、生硬，这种情况下会造成一定的痛苦，会造成鼻腔黏膜的出血、鼻腔疼痛，甚至会有病人明显的不适感。一般正规三甲医院专门有做内镜的检查医师，都是有多年经验的医师，相对来讲手法还是比较成熟的，所以病人不要有明显的心理负担。