肛瘘伤口塞纱布的时间取决于伤口的大小以及愈合情况，大概需要塞2~3周的时间。
因为患者的切口在术后2周进入肉芽组织快速生长期，一般的切口在术后3周左右肉芽就可以填满切口，此时就没必要在切口内继续填塞纱布。因为肛瘘术后切口塞纱布主要原因是因为肛瘘手术切口偏深，需要在切口内塞纱布防止粪便等污染物质进入切口，刺激切口导致感染而影响切口的愈合，也可以防止切口出现假性愈合，导致术后复发。
另外，在切口内塞凡士林纱布也可以促进切口肉芽生长，缩短切口愈合时间。