临床上低血糖综合征和倾倒综合征是两种不同的综合征，患者均表现为低血糖的交感神经兴奋的临床症状。两者主要有以下区别：
第一，病因不同。低血糖综合征常见的病因包括糖尿病患者应用降糖药物剂量过大，引起的药物性低血糖，胰岛β细胞瘤、腺垂体功能减退症，以及肿瘤相关性疾病引起的低血糖综合征。倾倒综合征的病因明确，见于胃大部切除术后的患者，患者大量进食面食后，大量的面食快速进入肠道，刺激胰岛素大量分泌，从而引起低血糖。
第二，临床处理不同。低血糖综合征的患者要在医生的指导下积极的寻找病因，对因治疗，低血糖才可纠正。倾倒综合征病因明确，需要在医生的指导下，调整饮食，少吃多餐，控制碳水化合物的摄入量，适当地增加蛋白类食物的摄入，可避免严重低血糖的发生。