目前建议停止母乳喂养，必要时给予抗病毒治疗。对于巨细胞病毒感染有症状如黄疸、肝功能损害等的这类患儿可以给予抗病毒治疗，抗病毒药物选用更昔洛韦。
对于有巨细胞病毒感染的母亲，是不是可以母乳喂养现在仍存在着一定的争议，大多数学者认为对于确诊的或者是怀疑有巨细胞病毒感染的患儿，如果母乳中查出来有巨细胞病毒建议停止母乳喂养。
对于有症状的先天性巨细胞病毒感染的患儿，死亡率相对比较高，存活的孩子也会有可能留有后遗症，比如自闭症、智力低下、听力损害或者视力损害等。