肛瘘的外口有大有小，小的确实像针眼一样，大的因为炎症刺激周围的纤维组织增生，会形成乳头状的凸起。
外口周围的组织都会比较硬，而且自外口处还能摸到索条样物，通向肛内。如果肛瘘的炎症比较轻，处于静止期，外口一般会闭合，不会向外流出脓血样物或粪便。
但如果肛瘘的炎症比较严重，处于感染活动期，外口是开放的，这时可自外口流出脓血样物，甚至是粪便。这时如果外口闭合，引流不畅，就会导致形成新的脓肿。