表皮样囊肿可以选择做头颅x线平片、ct以及核磁共振。头颅X线平片，少数的桥小脑角或者中颅窝的肿瘤可以见到岩骨尖或者岩骨嵴破坏。个别的病例可以表现为钙化影像比较惨淡。板障内的肿瘤的颅骨典型表现为溶骨样的病变，并显示锐利的硬化缘，其周围有骨髓炎者也并非少见。
ct扫描是表皮样囊肿最好的诊断手段，有助于描述囊肿的轮廓以及它的扩展的情况，囊肿显示为低密度影像，一般注射造影剂不显示强化。板障内的表皮囊肿可以呈膨胀性的破坏，边缘锐利的混杂密度影像。
核磁共振在表皮样囊肿的T1加权向像上表现边缘锐利的低信号。而T2的加权像为高信号。所以不同的检查方法，有不同的影像学的表现，首选的扫描还是ct检查。