对于腔隙性脑梗死的患者来说，在急性期往往会有许多相应的并发症，比如脑水肿颅内压增高。治疗的目的主要是降低颅内压并且同时还要保证有足够的脑灌注压，从而预防由于过低的血压导致出现了脑供血不足，加重了脑梗死。
一般建议使用甘露醇来静脉点滴。对于有肾功能不全的患者，或者有心功能障碍、心衰的患者，可以改用呋塞米。另外部分脑梗死的患者容易造成梗死后出血，对于这类患者而言首先应该停用溶栓药物，并且改为使用止血药物进行治疗。部分腔隙性脑梗死的患者还有可能会诱发癫痫发作。
如果一旦出现这样的情况，可以适当的应用抗癫痫药物来进行治疗。除此以外感染、上消化道出血、深静脉血栓以及合并有其他脏器功能障碍也较为多见，需要做相应的处理。