男性尿道口流脓，多数情况下是由于尿道细菌感染导致部分尿道黏膜坏死而引起。但是男性生殖器官开口于后尿道，当这些器官出现严重的细菌感染而形成脓液时，也会出现尿道口流脓的表现。同时，还需要注意有无脓肿存在的可能。
无论病变部位在生殖器官还是尿道，病因通常都是细菌感染，所以这类患者的根本治疗都是抗炎治疗。
如果有脓肿存在，需要在B超定位下行脓肿穿刺引流术将脓液引流。抗生素的选择以细菌培养和药敏试验结果为依据，所以患者均需要提取脓液行细菌培养和药敏试验检查。