对于真菌性食物中毒的患者，通常会有如下特点：
第一，潜伏期特别短，患者在食用了过量的真菌感染的物质以后，通常在两个小时到四个小时左右就会有胃肠道的症状，表现出上腹部的不适、恶心、呕吐、腹痛、腹胀，伴随腹泻等临床症状。
第二，还会出现循环系统的症状，表现出来胸闷、气短、心悸、心前区不适。严重时还会有呼吸道的症状，例如呼吸困难、窒息，甚至还会损伤肝功能和肾功能。患者会出现黄疸、血尿、蛋白尿、少尿，这些都属于真菌性食物中毒的特点。
中毒的同时还容易对于某些患者出现神经系统的症状，例如表现出头晕、头痛等临床特点。