肛裂会损伤肛门的，因为肛裂的溃疡面主要发生在肛管皮肤撕裂而成。
肛管的解剖学长度为1~3厘米，轻轻牵拉肛门，及可以很清楚地暴露肛裂溃疡面，一般呈梭形或者裂隙状，深度深浅不一。创缘在肛裂初期和慢性期而表现的完整和参差不齐，溃疡基底色泽鲜红和灰白。慢性肛裂可因为静脉和淋巴回流障碍，导致局部水肿和纤维组织增生，形成前哨痔。
局部感染时可形成皮下脓肿，溃疡面较大以及前哨痔并发感染时，造成局部充血水肿情况。可以损伤肛缘的完整性和功能，造成排便困难和肛门疼痛。