在临床上病毒性睾丸炎的患者会在急性发作时出现全身中毒的症状，如寒战、高热，也可以出现恶心、呕吐、腹痛等全身症状，轻则仅有不适，重的痛如刀割，阴囊出现红肿，附睾及精索可以伴发急性炎症，也可出现鞘膜积液。
在临床上，通过体检可以看到睾丸肿胀、触痛。阴囊的皮肤明显的水乳伴发附睾及精索炎者，附睾肿胀与睾丸界限不清楚，精索增粗、变硬，同时可见腮腺肿大。由于腮腺炎病毒需经血流到达各县级或中枢神经系统，因此睾丸炎，也可以出现在腮腺肿大之前。