小孩肺炎支原体感染需要先进行病原体的培养以及做药敏试验，再选择敏感度高的抗生素进行治疗，会有比较好的治疗效果。一般在治疗时，都会先使用大环内酯类药物进行治疗，病原体的培养和药敏试验也要同时进行。如果大环内酯类药物的治疗效果不理想，需要根据培养结果和药敏试验结果，选择更有效的药物进行治疗。
需注意小孩肺炎支原体感染容易反复发作，所以需要在治疗时，需要坚持用药，不可随意停换药物，以免影响治疗效果。
另外，小孩的抵抗力如果比较低，病情也不容易控制，可考虑给孩子注射丙球蛋白来提高抵抗力。