沙眼治疗的方法常见的有：
可以进行局部滴用眼药水，可以外用眼药膏。同时有一部分严重的病人还需要口服药物，根据沙眼的情况可以局部，或者是全身使用适当的抗生素。如出现并发症必要时给予手术治疗。可以每天给眼睛进行适当冲洗。可以采取中医的方法进行外敷治疗。
沙眼的患者在治疗期间要使用新的脸盆和毛巾，避免之前用过的洗漱用品有沙眼衣原体，然后加重沙眼。沙眼有一定的传染性，所以在患病期间应给予隔离治疗，个人用品要及时进行消毒。饮食不可食用辛辣、刺激性强的食物。沙眼少数患者还会有复发的可能，所以一定要治愈。出院后尤其注意眼部的卫生及生活习惯。