肾积水伴输尿管结石的患者，在治疗上主要需要从减轻肾积水和排出输尿管结石两方面进行，具体治疗需要结合病情，综合分析后决定。
如果肾积水较轻，短时间内对肾功能无明显影响。对于这类患者先排出输尿管结石，在无手术禁忌的情况下，先行体外冲击波碎石手术治疗。待输尿管结石排出后，肾积水可以逐渐好转。
如果肾积水病情严重，伴有严重的肾功能损害，可行穿刺置管引流，减轻肾积水，同时给予以保肾治疗。待肾功能好转后，再行体外冲击波碎石等手术治疗，去除输尿管结石。