男性不育检查的项目包括两大项，一项是外生殖器以及二性征查看，排查发育畸形引起的尿道下裂，影响阴茎正常发育、射精不能进入阴道导致的男性不育。另一项检查是实验室以及泌尿生殖道影像学检查，具体项目是采集精液做常规化验检查，排查精子质量低下导致的男性不育。
还需要采血做血液性激素化验、染色体等检查，通过了解血液性激素水平不足导致性功能低下，引起的男性不育疾病。
影像学利用彩超、造影等检查，排查睾丸生精功能异常，以及生殖管道梗阻导致的男性不育疾病。