本病主要是由于微小隐孢子虫所导致的一种主要以腹泻为主的传染病，临床上主要用于治疗隐孢子虫病的药物有螺旋霉素，也可以用克林霉素和阿奇霉素等进行治疗。
这些药物虽然有疗效，但是也有一定的副作用，会使患者出现腹泻、恶心、腹痛、呕吐、烧心等表现，有些患者可能还会出现肝脏的损害，一般停药就会消失。
患者会在感染后的7天内出现发热、恶心、呕吐、腹痛等症状，一定要及时到医院检查，如果患者因频繁的腹泻，发生了严重的电解质平衡紊乱，应当立即给予纠正。
如果是免疫力低下的患者，要采取支持治疗，要注意患者在发病期间不要食用糖分以及脂肪含量过多的食物。