支原体感染的治疗用药，主要包括抗炎药物、敏感性抗生素类药物，以及免疫球蛋白。如果支原体感染人群存在严重感染应激状态，可以短时间使用抗炎或糖皮质激素药物改善症状。
在敏感抗生素方面，一般可选择四环素类、喹诺酮类等治疗用药。免疫球蛋白不属于常规用药，一般在合并中枢神经系统病变、溶血等合并症时使用。
衣原体感染以大环内酯类抗生素为首选，如罗红霉素、克拉霉素等。如果疗效不佳，可调整为喹诺酮类抗生素，如莫西沙星、氧氟沙星等。