一般室间隔缺损大于1cm最好做手术治疗，具体治疗措施需结合患者年龄和症状来决定。
如果缺损小于5mm，没有出现反复感冒、发热引发肺炎等现象者，可先观察，定期做超声心动图，查看缺损处病变情况，良好者可到5岁后做手术封闭缺损。若有进展，缺损增大则应尽早行手术治疗。
如果缺损在5~10mm之间需严密观察，没有并发反复肺炎者可待2岁后行手术治疗。如果缺损大于1cm，应尽早手术，以免缺损引起心脏扩大和心力衰竭。