雾化吸入的药物有很多，大致可以分为激素类药物、β-受体激动剂、抗胆碱药物、化痰类药物等。
激素类药物，包括布地奈德吸入剂、倍氯米松等，可以用予控制气道炎症反应，可用于支气管哮喘或喘息性支气管炎等。β-受体激动剂，如特布他林，可以舒张支气管，缓解气道痉挛。抗胆碱药物，如吸入用复方异丙托溴铵，可以舒张支气管减少粘液分泌。
化痰类药物，包括吸入用的氨溴索、糜蛋白酶、乙酰半胱氨酸等，可以起到松解痰液、稀释痰液，促进痰液排出的作用。