腘窝囊肿还是需要进行病理检查的。一般情况下，针对于出现肿物性质的疾病，在进行手术切除以后都需要进行病理检查，从而明确诊断，因为病理诊断才是诊断的金标准。
虽然有些情况下，根据相应的病史、症状体征和磁共振、彩超以及血液检查等手段，可以进行初步的明确诊断，但是一切诊断的结果都要根据病理诊断的结果来进行确诊。
有些情况下，虽然经过初步地判断都表现为良性肿物的特点，但是有可能会出现少量的异型性细胞，是存在着恶变可能性的。也有可能在良性肿瘤中间存在着少量的、初步的恶变的细胞，这种情况下通过病理检查是能够发现的，从而能够及早地进行治疗或者干预。