对于大部分的口腔颌面部肿瘤来说，麻醉下进行的分期检查，是明确。诊断的关键包括了喉镜、食管镜、支气管镜的检查。上述检查可获取活检标本，进行原发灶的病理诊断，确定原发灶的范围以及明确有无其他的癌前病变或者第二原发癌。
原发灶不明的颈部肿块的评估是口腔颌面部肿瘤的一个特殊情况，锁骨上颈部淋巴结肿大可能来源于胸部或者甲状腺肿瘤。而左锁骨上淋巴结肿大，可能来源于腹部肿瘤。较高部位的进步，病变很可能是头颈部原发肿瘤。包括了头皮原发肿瘤发生播散的情况。细真的抽取活检，对于判断鳞状细胞癌有无淋巴结转移的准确性较高。但因强调的是，必须避免淋巴结的切开活检，这样会妨碍进步病灶的后续治疗，并可能降低进步转移。病变的控制率