小儿原发性心脏肿瘤要进行手术切除治疗。小儿原发性心脏肿瘤有恶性肿瘤，也有恶性肿瘤。肿瘤会影响心脏的功能，也有可能会导致心脏结构的破坏。所以发现肿瘤后要及早进行手术治疗，减少肿瘤患者心脏的破坏。
但是手术之前，要对患者的病情进行处理，尽量在病情平稳时进行手术治疗。如果患者有严重的血液力学的障碍，则无法进行手术治疗，只能以保守治疗为主，以减轻患者的症状，延长患者的生存时间为主。
心脏部位发生弥漫性肿瘤的患者，可以进行心脏移植。