从中医方面来讲，先天性睾丸发育不全，主要是由于肾功能下降所引起的，这时可以通过服用补肾类中药调理肾功能，进而治疗先天性睾丸发育不全。
先天性睾丸发育不全，会出现睾丸缩小、阴茎短小，全身症状会表现为头发枯黄、身材矮小、牙齿和喉结发育不全，这是由于睾丸发育不良时性激素分泌减少引起的。
这时可以服用中成药金匮肾气丸和三肾丸、锁阳补肾胶囊治疗，另外还可以用海马、淫羊藿、鹿鞭、鹿茸、续断、杜仲、益智仁等滋补肾阳的中药泡水服用，另外在服用中药或者中成药治疗时，饮食方面需忌口辛辣食物。