细粒棘球蚴病的潜伏期相对较长，同时个体差异比较大，平均潜伏期约在数年到数十年。易感人群通过消化道、呼吸道等途径，接触到细粒棘球蚴虫卵后，可以导致感染。
患者的临床症状出现，与寄生虫数量以及病变位置有关。如果寄生虫数量较少，同时未侵袭重要脏器，患者出现典型症状时间偏晚，大部分以并发症形式发现，甚至部分患者到临终也不能完全明确诊断。
如寄生虫数量较多或直接侵袭重要器官，患者出现典型临床症状时间较早，可早期发现。