对于阴囊坏疽主要是同阴囊的急性蜂窝织炎以及普通的阴囊感染相鉴别。比如应当由普通的毛囊炎或者内部睾丸炎以及附睾炎，也会导致阴囊部位的红肿、热痛，患者对阴囊触诊会有剧烈的疼痛感，特别是在急性发作期间，但是经过x线或者ct检查并未发现阴囊以及腹股沟有气性坏疽的产生，因此可以有效的鉴别诊断。
而对于急性蜂窝织炎也是阴囊常见的一种病变，但是阴囊坏疽更为严重，是多种细菌混合作用的结果，有阳性菌、阴性菌以及产气的细菌，都会导致阴囊坏疽。同时患者阴囊表面会出现发黑坏死，并伴有恶臭，必须及时去泌尿外科进行手术。一旦确诊阴囊坏疽必须进行及时治疗，否则会引起严重并发症。