月经结束后小腹隐隐作痛，要针对不同的疼痛原因进行治疗。
1.经期结束后小腹隐痛通常见于妇科疾病，比如子宫肌瘤、炎症、宫外孕等。如果是子宫肌瘤手术，可以摘除瘤体或者切除子宫。如果是炎症，可以进行抗炎治疗。如果是宫外孕，可以服用药物终止妊娠或者手术切除，以免引起大出血。
2.有些时候泌尿系统疾病，也会导致经期过后小腹隐痛。比如泌尿系结石、膀胱炎等，可以进行碎石排石治疗和抗感染治疗。
3.肠炎等也会导致月经过后小腹痛，明确后除了抗炎治疗外，还可以联合中医中药调理，促进消化系统功能和谐。