院内感染指的是在医院环境当中接触到致病病原微生物从而导致感染性疾病发生。
院内感染主要包括两方面人群，一方面是到医院就诊的患者以及陪护家属，另一方面为在医院环境下工作的医护人员。如果患者在入院前没有明显感染体征，在入院后四十八小时到七十二小时内出现感染症状，则常是由于在院内接触病原微生物导致的感染，属于院内感染。
相对于社区内感染，院内感染病原微生物的耐药谱存在一定差异，所以在临床用药方面需要进行鉴别。