新生儿如果检查出来有细菌感染，是可以吃头孢克肟的。
新生儿由于刚出生，很多用药还是比较谨慎的，一定要在医生的指导下来服用。由于年龄小、体重小，稍微不注意很容易导致药量过大。如果新生儿出现感染的症状，比如发烧、咳嗽等，经过检查化验，炎症指标又很高的情况下，是可以口服头孢克肟的。
由于新生儿是一个特殊的群体，病情进展是比较快的，如果口服药物效果不明显，家长一定要及时听从大夫的建议住院进行输液治疗，以免病情加重，导致治疗时间延长，甚至是对宝宝造成更严重的损伤。