大多数的先天性心脏病，在产前检查的过程中可以检查出来。对于心脏的畸形的检查是产前超声检查一个必须的检查项目。
一般在妊娠20~24周，要进行第1次胎儿系统的大畸形筛查。这一次筛查，主要筛查的目标的器官主要包括心血管系、统神经系统、泌尿生殖系统、消化系统等等。
先天性心脏病是一个重要的筛查指标。但是如果在超声检查的过程中，由于仪器设备的问题，或者由于孕妇腹壁较厚，或者是由于一些高龄的原因等等，需要进行心脏超声的进一步检查。建议要到相关的有专科胎儿心脏超声的医院进行检查，这样对于先天性心脏病筛出的比例会更高一些。