尿道综合征的典型症状为排尿疼痛、排尿困难、尿频等。疼痛多位于尿道、下腹部、腰部，在性生活时也会出现性交疼痛。
尿道综合征发病较急，一般呈周期性的发作，病程长短不太一样，短则1~2天左右，长则数月之久。目前并没有十分有效的药物能够治愈尿道综合征，一般是使用药物改善不适症状。当排尿困难、尿频等症状比较严重时，可通过使用坦索罗辛、萘哌地尔等药物进行治疗。
如果出现了轻度的尿失禁，可以使用硝苯吡啶治疗。患者在日常也要多休息，注意生理卫生，防止出现感染。