慢性肠炎的患者可以吃益生菌，尤其是患有慢性肠炎患者存在肠道菌群紊乱情况时，适当地吃益生菌可以调理肠道菌群，还可以抑制有害菌的繁殖。对于其他一些炎症性病变引起的慢性肠炎，单纯地吃益生菌进行治疗作用效果比较差。
所以，想要针对性地治疗慢性肠炎，需要根据病因对症选择药物治疗。一般在进行治疗时，除了对症治疗外，还需要使用一些保护肠黏膜的药物。
平时还需要多注意饮食上的调理，尽量减少对肠黏膜有损伤的食物或者是药物摄入量。