多囊卵巢综合征与卵巢囊肿并不是一样的，多囊卵巢综合征是一种内分泌疾病，是因为卵巢功能异常导致的。而卵巢囊肿是一种器质性病变，是因为卵巢上长了肿物，当然有良性的，也有恶性的，有生理性的，也有病理性的。大多数的卵巢囊肿并没有症状，都是在体检的时候B超检查发现的。
多囊卵巢综合征最典型的症状就是月经异常，主要表现为月经量减少，月经稀发，甚至闭经，同时伴有一些高雄激素血症的表现，比如多毛、痤疮，还有肥胖，会引起不孕不育。
多囊卵巢综合征有些人会表现为卵巢增大，卵巢表面见多个囊样改变，但是这些囊样改变并不是卵巢囊肿。