包皮长水泡如果发生于不洁性行为后，需要考虑受到性伴侣生殖道二型生殖疱疹病毒感染。可以采血做病原体抗原、抗体等检查，给予阿昔洛韦等药物抗病毒治疗。做好性保护，可有效预防包皮水泡反复发生。
包皮开口狭窄，堆积的包皮垢污染或大肠杆菌等病菌感染，也可引起包皮水泡现象发生，瘙痒感觉跟炎性刺激有关。可给予喹诺酮类药物抗炎治疗，感染得到有效控制，可安排时间做包皮环切手术处理。
养成良好的卫生清洗习惯，做好性保护，可有效预防包皮水泡、感染性水泡反复发生。