先天性副舟骨对运动是有一定影响的。
由于副舟骨的存在改变了胫后肌腱的正常止点位置及走行方向，走行方向和止点的改变，就破坏了胫后肌固有的提起足纵弓和使足内翻的作用，很容易导致平足，而且容易导致劳损而引起疼痛的症状。
另外，在行走时足纵弓的内侧凸起，舟骨结节肥大与鞋边摩擦，容易造成滑囊炎，胫后肌也容易引起腱鞘炎，产生肿胀、疼痛等症状。
这样在长时间的活动以及剧烈地运动的时候，就会感到局部疼痛不适，对运动是有一定影响的。