结节性硬化病患者可以通过药物控制癫痫发作。一部分药物难以控制患者，可用手术控制癫痫发作。癫痫是结节性硬化病的一个突出特征，表现为开始时痉挛症样发作，或小运动型发作。随着时间的推移，逐渐变成局限性发作，或大发作。
抗癫痫药物应用原则是以最小的有效剂量、最小的副作用，达到最好的治疗效果。婴儿痉挛发作可用ACTH治疗；单纯部分型发作首选卡马西平；全面发作、大发作首选丙戊酸钠。
药物难以控制的一部分患者，可选择手术治疗。手术方法是应用电极技术对结节进行定位，根据定位结果，进行手术切除。