轻度的甲状腺功能异常得到及时的治疗不会致死，如果重度的甲状腺功能异常没有发现，并且持久得不到治疗，就会引起严重的并发症比如甲状腺危象、甲亢性心脏病、甲减性的粘液性水肿，就会有生命危险会引起死亡。甲亢危象是指甲状腺毒症急性加重的综合征，发生的原因与循环内的甲状腺激素水平增高有关，多发生于较重的甲亢没有给予治疗或者是治疗不充分的患者，常见的诱因有感染、手术、创伤、精神刺激等，临床表现有高热、大汗、心动过速、烦躁、焦虑不安、谵妄、恶心、呕吐、腹泻，严重的患者可用心衰、休克甚至是昏迷，甲亢危象是非常严重的，需要紧急的处理，如果处理不及时它的病死率在20%以上。甲亢性心脏病引起的心衰，一个是心动过速和心脏排出量增加导致的心衰，主要发生在年轻的甲亢患者，这种心衰不是心脏泵功能的衰竭是由于心脏高排出量后失代偿引起的，称为高排出型心力衰竭，常常随着甲亢的控制，新功能会恢复。
另一种心衰是发生于老年的患者，是心脏泵的衰竭，心房纤颤是影响心脏功能的重要因素，在甲亢患者中10%到15%的患者会发生房颤，甲亢患者发生心衰时30%到50%的患者与房颤是相关的。再就是甲状腺功能减退，如果得不到及时的治疗，会引起粘液性水肿的昏迷，它是甲减病情加重的严重状态，诱因多为严重的全身性疾病。做甲状腺素治疗中断感染手术，积极使用麻醉或镇静剂等，临床表现为嗜睡、精神异常、木僵甚至昏迷，临床上已经非常罕见，它的特征包括低体温、心动过缓、低血压、呼吸衰竭和心力衰竭等，这种病发生与伴有心肺疾病的老年甲减的患者预后非常差，死亡率也能够达到20%左右。因此甲状腺功能异常如果得不到及时的治疗，会引起一系列的严重并发症，会导致患者死亡。