莱姆病性巩膜炎每个时期的症状是不同的。
第一期，被蜱虫叮咬1个月以内会出现皮肤的改变，呈慢性游走性的红斑。红色的斑丘疹在蜱虫的叮咬处，随着时间，然后红斑会逐渐扩大呈充血状态。部分中间的区域带清晰可见，病变外缘处是红色，中心部有时也会呈红色且质地较硬，会变成疱疹或者是坏死。
第二期，被叮咬后数月会发生神经系统的症状，比如脑膜炎、面部神经炎症以及心脏疾病。眼部表现为视神经炎症、视盘水肿，以及缺血性视神经发生病变。
第三期，被叮咬后2年以后的表现为关节炎症、精神障碍、神经精神病等症状。
不同时期症状是不相同的。